Komnenos hanedanı Trabzon’da klasik Bizans bürokrasisinin sadeleşmiş bir versiyonunu kurdu; merkezi otorite güçlü görünse de aslında yerel unsurlar ve ticari ilişkilerle ayakta duran esnek bir yönetim modeli benimsendi. İmparatorluk, geniş topraklara hükmeden bir yapıdan çok, liman ve ticaret hatlarını kontrol eden bir şehir devleti gibi işledi. Saray ve aristokrasi Bizans geleneğini sürdürürken, ekonomik sistem büyük ölçüde tüccar sınıfına dayanıyordu. Bu nedenle Trabzon’daki yönetim modeli, katı bir imparatorluk sisteminden ziyade pragmatik ve uyarlanabilir bir yapı olarak öne çıktı.